daniel84 ciao e benvenuto! :) personalmente EAGLE non l'ho mai usato, a suo tempo di Autodesk ho soolo usato il classico AutoCAD, su Windows. Da quanto vedo (eagle.autodesk.com) l'ultima versione è la 9.6.0, la versione che usi tu è di cinque anni fa.
Onestamente non so se per Linux si riesca a trovare una versione craccata, casomai puoi fare questo: se il software non è eccessivamente pesante, puoi pensare di usarlo tramite Wine, quindi senza dover fare uso di Windows in modo separato (altro PC, Dual Boot o VM che sia), il software Wine ti consente di eseguire applicazioni Windows in ambiente Linux. Quindi potresti risolvere in questo modo. Se poi sia ben funzionale o meno, dipende principalmente dalle risorse che vengono richieste dal programma la compatibilità in sé dovrebbe essere garantita. Credo si possa quindi fare questo tentativo e speriamo in bene! 🙂